ارائه ی یک الگوریتم رقابت استعماری جهت پیشگویی ساختار فوق ثانویه ی پروتئین ها به کمک اطلاعات ساختاری قطعات با ساختار دوم

پایان نامه
چکیده

پروتئینها ماکروملکولهایی هستند که تمام اعمال مهم در ارگانیسمها از جمله انتقال مواد غذایی، تشخیص و انتقال پیامها انجام میدهند. از آنجا که عملکرد پروتئینها وابسته به ساختار فضایی آنهاست، پیشگویی ساختار فضایی پروتئین حائز اهمیت است. هدف از این تحقیق پیشگویی ساختار پروتئین با استفاده از اطلاعات ساختاری ساختار دوم است. در روش پیشنهادی در این تحقیق، با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری، تعدادی ساختار فوق ثانویه از پروتئین گرفته می شود و سپس بهترین ساختار فوق ثانویه پیش گویی می شود. برتری این روش نسبت به سایر روشهای موجود این است که اطلاعات ساختاری ساختار دوم به عنوان ورودی الگوریتم منجر به پیشگویی دقیقتری میشود که به ساختار فضایی پروتئین نزدیکتر است.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ارائه یک روش نوین جهت تعیین قوت واترمارک با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری

Watermarking systems have specific feathers in accordance with their applications. In many applications transparency and robustness are needed which are the most important features. These two features are in contrast to each other and are controlled by a parameter named watermark strength. With decreasing the watermark strength, transparency of the watermarking system increases while the robust...

متن کامل

پیشگویی دقیق ساختار دوم RNA مبتنی بر الگوریتم ژنتیک

مولکول RNA نقش مهم و اساسی در فرآیندهای زیستی ایفا می¬کند. در بیشتر مواقع، عملکرد RNAها توسط ساختار آنها مشخص می¬شود. با توجه به پیچیدگی و هزینه بر بودن روش¬های آزمایشگاهی برای پیشگویی ساختار RNAها، از روش¬های محاسباتی استفاده می¬گردد. الگوریتم¬های متنوعی جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول RNA وجود دارد. در این مقاله، یک الگوریتم ژنتیک بنام RNAG جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول RNA براساس حداقل انرژی ...

متن کامل

کاربرد یک الگوریتم اصلاحی رقابت استعماری برای حل مسأله ی فروشنده دوره‌گرد

این مقاله یک روش رقابت استعماری اصلاح‌شده را برای حل مسأله فروشنده دوره‌گرد ارائه می کند که در تابع جذب بین کشورهای استعمارگر و استعمار شده و هم چنین انقلاب کشورهای مستعمره، با حالت معمولی خود تفاوت دارد. به علاوه برای افزایش کارایی الگوریتم از روش بهبود دهنده ی سه‌گانه استفاده می‌شود. الگوریتم جدید روی 19 مثال استاندارد مسأله فروشنده دوره‌گرد از کتابخانه TSPLIBمورد آزمایش و با الگوریتم‌های رقا...

متن کامل

ارائه ی یک روش نوین جهت تعیین ثوابت معیار شکست نرم لوله ی درزدار فلزی به کمک فرآیند هیدروبالجینگ

در پژوهش حاضر،به بررسی عددی و تجربی شکست نرم پیش­رونده در فرآیند انبساط­دهی آزاد لوله فولادی زنگ­نزن 304 درزدار، به کمک فشار روغن پرداخته شده است. در بخش عددی که از روش المان محدود لاگرانژی به کمک حل­گر صریح نرم­افزار آباکوس استفاده شد؛ درز جوش به صورت یک نوار نازک، حاوی ضریب ناهمگنی نقص در استحکام و شکل­پذیری مدل گردید. از دیاگرام حد شکل­دهی (FLD) به عنوان معیار شروع آسیب و از پارامتر جابه­جای...

متن کامل

پیشگویی دقیق ساختار دوم rna مبتنی بر الگوریتم ژنتیک

مولکول rna نقش مهم و اساسی در فرآیندهای زیستی ایفا می¬کند. در بیشتر مواقع، عملکرد rnaها توسط ساختار آنها مشخص می¬شود. با توجه به پیچیدگی و هزینه بر بودن روش¬های آزمایشگاهی برای پیشگویی ساختار rnaها، از روش¬های محاسباتی استفاده می¬گردد. الگوریتم¬های متنوعی جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول rna وجود دارد. در این مقاله، یک الگوریتم ژنتیک بنام rnag جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول rna براساس حداقل انرژی آ...

متن کامل

ساختار زبان شفیعی کدکنی در « هزاره ی دوم آهوی کوهی

در این مقاله، ابتدا با تکیه بر دو تعریف و توصیف دکتر شفیعی کدکنی از شعر، اولا" «زبان»  به مثابه‌ی یکی از عنصرهای سازنده‌ و نیز بستری که «شعر چونان حادثه‌ای در آن روی می‌دهد»، بررسی گردیده و ثانیا" به نقش ارتباطی و یگانه ساز آن در میان «نجواگر و شنونده»، اشاره شده است. بنابراین، مباحثی نظیر تفاوت زبان شعر و زبان روزمره، «نارسایی زبان در القای ما فی الضمیر»، «زبان و اندیشه» و «زبان و جامعه» به ا...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کاشان - دانشکده مهندسی کامپیوتر

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023